Struktur zeigt der Suchmaschine die relevanten Bereiche und Inhalte einer Website. Struktur erhält eine z.B. über Verlinkungen, meist über das Navigationsmenü und dessen hierarchischen Aufbau und der Gliederung in Haupt- und Unterpunkte.
Neben den über die Navigation strukturiert erreichbaren Inhaltsseiten im gesamten sind es auch die Inhalte der einzelnen Seiten, die durch Struktur der Suchmaschine die Lesbarkeit ermöglichen. So dienen Textüberschriften auf einer Seite nicht nur der ansprechenden Gestaltung und Gliederung der Inhalte für die Benutzer, sondern verhelfen auch den Suchmaschinen zur strukturierten Erfassung und Bewertung der Inhalte. Hier sind es vor allem die HTML-Überschriften der Formatvorlagen H1 – H5, die der Suchmaschine helfen, die Wichtigkeit von Inhalten zu unterscheiden. Mehrfach auf einer Seite gesetzte H1-Überschriften sind vielleicht gestalterisch sinnvoll, nehmen aber der Suchmaschine die Möglichkeit der Unterscheidung von Inhalten und deren Bewertung nach Relevanz.
Fett geschriebene Worte und Satzteile oder Aufzählungen haben ihre Bedeutung bei der Optimierung einer Webseite mittlerweile verloren. Auch die abwechselnde Schreibweise von Begriffen mit Umlauten, also sowohl „Mühe“ als auch „Muehe“ oder die Wortwiederholung von Schreibweisen in Einzahl und Mehrzahl sind heute für SEO nicht mehr hilfreich. Die Google Suchalgorithmen sind längst ausgeklügelt und intelligent genug, um selbst konkrete Zusammenhänge verschiedener Worte zu erkennen. Größenangaben in einem Onlineshop für Schuhe werden in den richtigen Zusammenhang gebracht und entsprechend interpretiert und z.B. von einer Preisangabe unterschieden.